Los parámetros tras # o fragmentos (fragments) sirven para, por ejemplo, enlazar a comentarios o determinadas partes de una web cuando tiene mucho texto. Por ejemplo:

http://domain.com/path#fragment

Según esta respuesta de Google, Google ignora estos parámetros cuando reastrea, indexa y ranquea una página, por lo que no puede ser contenido duplicado.

Nosotros generalmente ignoramos los “fragmentos” (tipo http://domain.com/path#fragment) cuando rastreamos, indexamos y ranqueamos ya que generalmente solo sirve de cara al usuario (client side, no interviene el servidor). Hay algunos casos en los que experimentamos mostrándolos en los snippets, para ayudar al usuario a encontrar lo que busca más rápidamente dentro de la páigna. Por lo tanto, si tienes páginas gandes, es algo a considerar. No necesitas (ni puedes) mencionar estos fragmentos en Herramientas para Webmasters.